Charlotte vann med hela 27,4 sekunder före Maria Rydqvist över endast 3,3 kilometer i lördagens prolog. Med det kan hon kontrollera jaktstarten i klassisk stil under lördagen.
Anna Haag, Lina Andersson och Anna Olsson var bland de som saknades och som kanske kunde ha blandat sig i tätstriden.
Nu jagas istället tvåan Maria Rydqvist närmast av Britta Norgren, som å sin sida har Ida Ingemarsdotter bara två sekunder bakom.
Bäst av icke-landslagstjejerna var Carolin Andersson från Gellivare Skidallians på en fin 5:e plats, precis före cupledarinnan Ingrid Vikman, som är 40 sekunder efter Charlotte Kalla.